Instrucciones sobré por qué convertir de MyISAM a innoDB y cómo hacerlo en:
https://sites.google.com/site/moodlemayhem/tcea2011-moodle-server-setup-basics/moodleacidtrip
y dos vídeos demostrándolo en:
http://www.edsupport.cc/mguhlin/moodlevideos/myisam2innodb.mp4
http://www.edsupport.cc/mguhlin/moodlevideos/myisam2innodbpart2.mp4